في هذا الجزء يعمل فريق البحث العلمي الخاص (SSSP) كوكالة سرية، ويكتشف شينجيرو هاياتا) ابن (شين هاياتا). أنه ورث لقب ألترا مان من والده، إلى جانب معرفته بوجود غزو فضائي جديد ومرعب يهدد الأرض. ورغم امتلاكه لقوى والده وبدلة مدرعة مذهلة، إلا أن شينجيرو ما زال عليه أن يتعلم الكثير لكي يتمكن من النجاة في هذه الحرب السرية.